edf壹定发

全体研究组长

王光中
博士 研究员 博士生导师

中科院计算生物学重点实验室,系统神经科学课题组组长

研究方向:生物信息学、系统神经科学

电子邮件(E-mail ) guangzhong.wang@picb.ac.cn

电话(Tel) 86-21-54920578

邮政编码 200031

课题组网站http://www.picb.ac.cn/neurosys/index.html

简历 & 研究方向

2017-   edf壹定发-马普学会计算生物学伙伴研究所 研究员

2011-2016美国得克萨斯西南医学中心 博士后

2007-2010 德国杜塞尔多夫大学 计算机科学 博士

2002-2006 山东理工大学 生命科学 

 

研究方向

1.通过分析、整合全脑水平的大数据以说明大脑的工作原理;

2.大脑发育的转录组动力学;

3.细胞转录和翻译系统的普适设计原理。

目前本实验室有两个重点研究方向:

1. 全脑水平大数据的整合分析。本项目的研究目的是在大脑各个脑区的分子特征以及功能性活动之间建立关联。本项目的具体目标是:1)识别大脑的脑区间连接与细胞类型特异性基因表达之间的关系。2)研究是否脑区间的细胞类型特异性和连接的差异可以反映大脑功能性活动的差异(例如小鼠静息状态下的fMRI)。3)通过比较人类,小鼠和非人类灵长类动物的大脑转录组数据以洞察人类脑细胞独特的类型演变方式。

2. 早期大脑发育的转录组动力学。最近研究发现在人类大脑发育期间存在全基因组水平的转录组重塑。例如神经发育疾病基因(如自闭症基因)在出生后上调并出现峰值,表明这些基因在此阶段存在关键的发育节点。在此基础上,大家将利用二代测序技术来研究早期人类和小鼠大脑中的转录组动力学。本项目的详细目标是:1)确定在大脑发育过程中导致转录组重塑的关键基因。 2)模拟代谢网络如何影响大脑发育。 3)利用关键基因敲除小鼠对早期脑发育中的转录组变化进行建模。

 

代表性论文(* 通讯编辑

1. Stefano Berto#, Guang-Zhong Wang#, James Germi, Bradley C. Lega, and Genevieve Konopka. Human Genomic Signatures of Brain Oscillations During Memory Encoding, Cerebral Cortex, 2017; 1–16, doi: 10.1093/cercor/bhx083 (Equal contribution).

2. Simone Marini, Nelson Nazzicari, Filippo Biscarini, and Guang-Zhong Wang*. Dscam1 Web Server: online prediction of Dscam1 self- and hetero-affinity, Bioinformatics, 2017, 33(12):1879-1880 (Co-corresponding author).

3. Guang-Zhong Wang, Stephanie L. Hickey, Lei Shi, Hung-Chung Huang, Prachi Nakashe, Nobuya Koike, Benjamin P. Tu, Joseph S. Takahashi, and Genevieve Konopka. Cycling transcriptional networks optimize energy utilization on a genome scale, Cell Report, 2015, 13(9):1868-80

4. Guang-Zhong Wang#, T. Grant Belgard#, Deng Mao, Leslie Chen, Stefano Berto, Todd M. Preuss, Hanzhang Lu, Daniel H. Geschwind, and Genevieve Konopka. Correspondence between resting state activity and brain gene expression, Neuron, 2015, 88(4):659-66 (Equal contribution).

5. Guang-Zhong Wang#, Simone Marini#, Xinyun Ma, Qiang Yang, Xuegong Zhang, and Yan Zhu. Improvement of Dscam homophilic binding affinity throughout Drosophila evolution, BMC Evol. Biol., 2014, 14(1):186 (Equal contribution).

6. Genevieve Konopka, Tara Friedrich, Jeremy Davis-Turak, Kellen Winden, Michael C. Oldham, Fuying Gao, Leslie Chen, Guang-Zhong Wang, Rui Luo, Todd M. Preuss, and Daniel H. Geschwind. Human-specific transcriptional networks in the brain, Neuron, 2012, 75(4):601-617

7. Guang-Zhong Wang, Wei-Hua Chen, and Martin J. Lercher. Co-expression of linked gene pairs persists long after their separation, Genome Biol. Evol., 2011, 3:565-70

8. Guang-Zhong Wang, Martin J. Lercher, and Laurence D. Hurst. Transcriptional coupling of neighbouring genes and gene expression noise: evidence that gene orientation and non-coding transcripts are modulators of noise, Genome Biol. Evol., 2011, 3:320-31

9. Guang-Zhong Wang and Martin J. Lercher. Amino acid composition in endothermic vertebrates is biased in the same direction as in thermophilic prokaryotes, BMC Evol. Biol., 2010, 10:263

10. Tobias Warnecke, Guang-Zhong Wang, Martin J Lercher, and Laurence D Hurst. Does negative auto-regulation increase gene duplicability? BMC Evol. Biol., 2009, 9:193-121

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