edf壹定发

全体研究组长

Philipp Khaitovich
博士 研究员 博士生导师

中组部“外专千人计划”入选者,中国国家友谊奖,edf壹定发青年科学家国际合作奖获得者

中科院计算生物学重点实验室,比较生物学课题组组长

研究方向:灵长类动物脑结构复杂特性以及人类大脑进化机制

电子邮件(E-mail):khaitovich@eva.mpg.de

电话(Tel):021-54920454

邮政编码:200031

课题组网站:http://www.picb.ac.cn/Comparative/

简历 & 研究方向

2006 - 至  今   edf壹定发-马普学会计算生物学伙伴研究所,青年科学家小组组长,研究员
  2012 - 2017年 edf壹定发-马普学会计算生物学伙伴研究所,所长

2003 - 2006年   德国莱比锡马普人类进化所,项目组长
2000 - 2003年   德国莱比锡马普人类进化所,博士后
1999 - 2000年   美国芝加哥大学伊丽诺斯分校,博士后
1995 - 1999年   美国芝加哥伊利诺伊大学芝加哥分校,分子生物学系,博士
1994– 1995年   俄罗斯普希诺蛋白质研究所,实习
1990– 1994年   俄罗斯莫斯科国立大学,分子生物学系,学士

研究方向

主要从事灵长类动物脑结构复杂特性的分子机制研究,以及人类特异基因表达的进化模式和寻找作用于人类特有表型特征的关键基因,揭示在人类进化历程中正选择的基因对人类潜在特殊能力,尤其是人类认知能力方面的分子机制。主要研究包括
1.通过分析转录组、代谢组、脂质组等多组学分子数据,研究人脑从发育到衰老过程的分子和调控机制;
2.通过比较人类和近缘灵长类动物脑部从发育衰老全过程中的转录组、代谢组、脂质组等多种分子水平的变化,鉴定人脑特有的分子变化特征并据此探索人脑特有功能进化的机制;
3.通过比较健康人脑和认知相关疾病的人脑在多组学上的差异,研究人脑发达认知能力形成的进化机制;

代表性论文(* 通讯编辑)

1. Li, Q., K. Bozek, C. Xu, Y. Guo, J. Sun, S. Paabo, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, Y. Li, L. Willmitzer, P. Giavalisco and P. Khaitovich*. "Changes in Lipidome Composition During Brain Development in Humans, Chimpanzees, and Macaque Monkeys." Mol Biol Evol 34, no. 5 (2017): 1155-1166.

 

2. He, Z., D. Han, O. Efimova, P. Guijarro, Q. Yu, A. Oleksiak, S. Jiang, K. Anokhin, B. Velichkovsky, S. Grunewald and P. Khaitovich*. "Comprehensive Transcriptome Analysis of Neocortical Layers in Humans, Chimpanzees and Macaques." Nat Neurosci 20, no. 6 (2017): 886-895. 

 

3. Liu, X., D. Han, M. Somel, X. Jiang, H. Hu, P. Guijarro, N. Zhang, A. Mitchell, T. Halene, J. J. Ely, C. C. Sherwood, P. R. Hof, Z. Qiu, S. Paabo, S. Akbarian and P. Khaitovich*. "Disruption of an Evolutionarily Novel Synaptic Expression Pattern in Autism." PLoS Biol 14, no. 9 (2016): e1002558. 

 

4. Wei, Y. N., H. Y. Hu, G. C. Xie, N. Fu, Z. B. Ning, R. Zeng and P. Khaitovich*. "Transcript and Protein Expression Decoupling Reveals Rna Binding Proteins and Mirnas as Potential Modulators of Human Aging." Genome Biol 16,  (2015): 41. 

 

5. Bozek, K., Y. Wei, Z. Yan, X. Liu, J. Xiong, M. Sugimoto, M. Tomita, S. Paabo, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, Y. Li, D. Steinhauser, L. Willmitzer, P. Giavalisco and P. Khaitovich*. "Organization and Evolution of Brain Lipidome Revealed by Large-Scale Analysis of Human, Chimpanzee, Macaque, and Mouse Tissues." Neuron 85, no. 4 (2015): 695-702. 

 

6. Khrameeva, E. E., K. Bozek, L. He, Z. Yan, X. Jiang, Y. Wei, K. Tang, M. S. Gelfand, K. Prufer, J. Kelso, S. Paabo, P. Giavalisco, M. Lachmann and P. Khaitovich*. "Neanderthal Ancestry Drives Evolution of Lipid Catabolism in Contemporary Europeans." Nat Commun 5,  (2014): 3584. 

 

7. Bozek, K., Y. Wei, Z. Yan, X. Liu, J. Xiong, M. Sugimoto, M. Tomita, S. Paabo, R. Pieszek, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, D. Steinhauser, L. Willmitzer, J. Bangsbo, O. Hansson, J. Call, P. Giavalisco and P. Khaitovich*. "Exceptional Evolutionary Divergence of Human Muscle and Brain Metabolomes Parallels Human Cognitive and Physical Uniqueness." PLoS Biol 12, no. 5 (2014): e1001871. 

 

8. Mazin, P., J. Xiong, X. Liu, Z. Yan, X. Zhang, M. Li, L. He, M. Somel, Y. Yuan, Y. P. Phoebe Chen, N. Li, Y. Hu, N. Fu, Z. Ning, R. Zeng, H. Yang, W. Chen, M. Gelfand and P. Khaitovich*. "Widespread Splicing Changes in Human Brain Development and Aging." Mol Syst Biol 9,  (2013): 633. 

 

9. Liu, X., M. Somel, L. Tang, Z. Yan, X. Jiang, S. Guo, Y. Yuan, L. He, A. Oleksiak, Y. Zhang, N. Li, Y. Hu, W. Chen, Z. Qiu, S. Paabo and P. Khaitovich*. "Extension of Cortical Synaptic Development Distinguishes Humans from Chimpanzees and Macaques." Genome Res 22, no. 4 (2012): 611-22. 

 

10. Khaitovich, P., I. Hellmann, W. Enard, K. Nowick, M. Leinweber, H. Franz, G. Weiss, M. Lachmann and S. Paabo. "Parallel Patterns of Evolution in the Genomes and Transcriptomes of Humans and Chimpanzees." Science 309, no. 5742 (2005): 1850-4.

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