edf壹定发

全体研究组长

Andrew E. Teschendorff
博士 研究员 博士生导师

中科院计算生物学重点实验室,计算系统基因组学课题组组长

研究方向:统计生物信息学,主要关注癌症表观基因组和癌症系统生物学的统计学分析。研究目的是应用新的计算方法帮助理解癌症发生过程并开发新型风险预测和一般癌症早期检测方法。

电子邮件(E-mail):andrew@picb.ac.cn

电话(Tel):86-21-54920659

邮政编码:200031

课题组网站:http://www.picb.ac.cn/compsysg/index.php

简历 & 研究方向

2013-至 今: edf壹定发-马普学会计算生物学伙伴研究所,研究员
2008-至 今: 英国伦敦学大学学院(University College London),癌症研究所统计癌症基因组学

  2008-2013年:Principal Research Associate

  2015-2018年:英国皇家学会 Newton Advanced Fellow
2003-2008年:英国剑桥大学肿瘤系乳腺癌功能基因组学实验室(Carlos Caldas教授领衔),

                        Senior Postdoctoral Fellow

2001-2003年:University of Warwick数学研究所数学生物学研究组( David A. Rand教授领衔),

                        Research assistant
2000-2001年:British Telecom Labs复杂性研究组(Sverrir Olafsson博士领衔),

                        Research staff scientist

1996-2000年:  英国剑桥大学,获理论粒子物理博士学位
1995-1996年:  英国剑桥大学,Certificate of Advanced Study,数学专业,Awarded Distinction
1990-1995年:英国爱丁堡大学,学士学位,数理物理学专业, Awarded 1st Class

研究方向

  研究方向主要是统计生物信息学,主要关注癌症表观基因组学和癌症系统生物学的统计学分析。研究的目的是应用创新的计算学方法帮助理解肿瘤形成并开发新的一般癌症风险预测和早期诊断工具。

代表性论文(* 通讯编辑)

1. Teschendorff AE*, Relton CL. Statistical and integrative system-level analysis of DNA methylation data. Nat Rev Genet. 2018 ;19(3):129-147.

2. Teschendorff AE*, Enver T. Single-cell entropy for accurate estimation of differentiation potency from a cell's transcriptome. Nat Commun, 2017, 1;8:15599

3. Zheng SC, Beck S, Jaffe AE, Koestler DC, Hansen KD, Houseman AE, Irizarry RA, Teschendorff AE*. Correcting for cell-type heterogeneity in epigenome-wide association studies: revisiting previous analyses. Nat Methods, 2017, 28;14(3):216-217

4. Teschendorff AE*, Gao Y, Jones A, Ruebner M, Beckmann MW, Wachter DL, Fasching PA, Widschwendter M, DNA methylation outliers in normal breast tissue identify field defects that are enriched in cancer, Nat Commun, 2016 Jan 29;7:10478

5. Teschendorff AE*, Yang Z, Wong A, Pipinikas CP, Jiao Y, Jones A, Anjum S, Hardy R, Salvesen HB, Thirlwell C, Janes SM, Kuh D, Widschwendter M. Correlation of Smoking-Associated DNA Methylation Changes in Buccal Cells With DNA Methylation Changes in Epithelial Cancer, JAMA Oncol, 2015 Jul 1;1(4):476-85.

6. Teschendorff AE*, Marabita F, Lechner M, Bartlett T, Tegner J, Gomez-Cabrero D, Beck S. A Beta-Mixture Quantile Normalisation method for correcting probe design bias in Illumina Infinium 450k DNA methylation data, Bioinformatics, 2013 15;29(2):189-96.

7. Teschendorff AE*, Miremadi A, Pinder SE, Ellis IO, Caldas C. An immune response gene expression module identifies a good prognosis subtype in estrogen receptor negative breast cancer Genome Biology, 2007, 8(8):R157

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